El tratamiento ocupa un lugar importante en la MTC, se trata de un estudio en el cual se aplican las teorías y conocimientos básicos, así como las técnicas fundamentales en la clínica, con el objetivo de tratar y prevenir las patologías. La clave del estudio terapéutico se encuentra en la diferenciación de los síndromes. Dicha diferenciación significa buscar el desencadenante y la fisiopatología, localizar la afectación en las vísceras o entrañas, en los meridianos principales o secundarios, al nivel superficial o interno, ver la característica de la enfermedad (los ocho cuadros básicos de la clínica, y por último separar la enfermedad etiológica de la sintomática, la aguda de la crónica).